土の微生物学

目次

１．土の微生物
１．１　微小な細胞の生き物
１．２　土の微生物と系統分類
１．３　細菌
１．３．１　プロテオバクテリア
１．３．２　グラム陽性菌
１．３．３　シアノバクテリア
１．３．４　環境ＤＮＡの解析による土壌優占細菌
１．４　アーキー
１．４．１　クレンアーキオータ
１．４．２　ユリアーキオータ
１．４．３　コルアーキオータ
１．５　真核微生物
１．５．１　菌類、真菌類
１．５．２　粘菌類
１．５．３　原生動物
１．５．４　藻類
１．６　ウイルス、ファージ
２．微生物の増殖と飢餓または耐久
２．１　微生物の栄養
２．１．１　炭素源、窒素源
２．１．２　エネルギー源
２．１．３　生物間相互関係と微生物の栄養
２．２　微生物の増殖
２．２．１　微生物の分裂、伸長
２．２．２　培養と微生物の増殖
２．２．３　増殖の環境条件
２．２．４　選択的培地と集積培養
２．２．５　培養困難な土の微生物
２．３　微生物の飢餓または耐久
２．３．１　微生物の飢餓細胞
２．３．２　微生物の耐久体
２．３．３　鉱物化細菌
３．土のすみ場所と微生物群集
３．１　すみ場所
３．１．１　土の骨格を構成する物質
３．１．２　固体表面とミクロな環境
３．１．３　孔隙の径および内部の溶液、気体
３．１．４　土の団粒モデル
３．１．５　微生物の動態と団粒モデル
３．１．６　洗浄・音波法による微生物細胞の分画
３．１．７　ミクロ団粒内の細菌の形態
３．２　土の微生物群集
３．２．１　細菌、糸状菌、原生動物、藻類
３．２．２　発酵型微生物、固有型微生物、低栄養微生物
３．２．３　細菌群集とコロニー形成曲線
３．２．４　森林、草地、畑、水田の微生物群集
３．２．５　気候帯、土地高度による微生物群集構造の違い
４．植物と土の微生物
４．１　微生物－植物の活発な相互作用の場、根圏
４．１．１　根から土壌に分泌される有機物
４．１．２　根圏に生息する微生物
４．１．３　根圏の植物日和見感染菌
４．１．４　根圏における植物と微生物、原生動物の相互関係
４．２　葉面微生物
４．２．１　葉面細菌と色素生産
４．２．２　葉面の窒素固定菌
４．２．３　葉面細菌の生態
４．３　植物と窒素固定菌の共生
４．３．１　マメ科根粒菌
４．３．２　Ｆｒａｎｋｉａ属放線菌
４．３．３　地衣類
４．４　菌根菌
４．４．１　アーバスキュラー菌根
４．４．２　外生菌根
４．４．３　エリコイド菌根
４．４．４　ラン型菌根
４．５　エンドファイト
４．６　Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍによる根頭癌腫
４．６．１　根頭癌腫の形成過程
４．６．２　Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍを用いた植物への遺伝子導入
４．７　病原微生物
４．７．１　土壌病害
４．７．２　土壌病害を引き起こす微生物
５．土の物質変化と微生物
５．１　炭素サイクルと微生物
５．１．１　二酸化炭素から有機炭素の合成
５．１．２　高分子有機物の分解
５．１．３　メタンの生成と消費
５．２　窒素サイクルと微生物
５．２．１　窒素固定
５．２．２　硝化
５．２．３　硝酸還元、脱窒
５．２．４　アナモックス反応
５．２．５　有機化（不動化）
５．２．６　アンモニア化成
５．３　硫黄サイクルと微生物
５．３．１　硫黄酸化
５．３．２　硫酸還元
５．３．３　揮発性有機硫黄化合物
５．４　鉄、マンガンの酸化、還元と微生物
５．５　土壌中のリンと微生物
５．６　難分解性有機化合物の分解とバイオレメディエーション
５．６．１　油
５．６．２　有機ハロゲン化合物
５．６．３　重金属汚染とバイオレメディエーション
６．人間の生活と土の微生物
６．１　衛生環境としての土の微生物
６．１．１　腸内細菌などの汚染と土の浄化能
６．１．２　土に生存または生残する病原細菌、食中毒細菌
６．１．３　土に生存する病原性の糸状菌、原生動物
６．１．４　増大する土の薬剤耐性菌
６．２　地下水と微生物
６．２．１　土の表層から下層への微生物の移動
６．２．２　地下水中の微生物
６．３　耐久材の微生物劣化
６．３．１　土中の金属腐食
６．３．２　コンクリートの劣化
６．３．３　木材、プラスチック
６．４　野外文化財の微生物劣化
６．４．１　地表文化財と微生物
６．４．２　地中埋蔵文化財の微生物による劣化、腐朽
７．地球環境からみた土の微生物
７．１　大気の温室効果ガスと土の微生物の働き
７．１．１　土の微生物による二酸化炭素とメタンの生産と消費
７．１．２　微生物による窒素酸化物の吸収と放出
７．２　酸性雨と土の微生物
７．２．１　土の緩衝作用と酸性雨
７．２．２　酸性雨に対する微生物群集の反応
７．３　高濃度の窒素、リン肥料による土の微生物活動への影響と環境汚染
７．３．１　土壌病害の多発
７．３．２　植物根－菌根菌共生系の抑制
７．３．３　生物的窒素固定の抑制
７．３．４　土のメタン酸化活性の抑制と促進
７．３．５　硝酸態窒素による地下水・河川水の汚染
７．４　森林伐採・開墾や森林火災が土の微生物群集へ及ぼす影響
７．４．１　糸状菌
７．４．２　細菌
７．４．３　窒素サイクルへの影響
７．４．４　開墾畑における森林由来の植物病原菌
７．５　地球史の中の土の微生物
７．５．１　大陸地殻の形成と変遷
７．５．２　微生物の進化と大地
７．５．３　生態系の進化と土の微生物
７．５．４　人間の活動と土の微生物
索　引